Začeci Geofizičkog odsjeka padaju u davnu 1861. organiziranjem prvih sustavnih meteoroloąkih motrenja u nas, ąto se postupno ąirilo i na djelatnosti u okviru ostalih područja geofizike: fiziku atmosfere, fiziku čvrste Zemlje i fiziku mora. Već se 1862. objavljuju izvjeątaji o vremenu u Zagrebu, a koncem 19. stoljeća Andrija Mohorovičić, predstojnik tadaąnjega Geofizičkog zavoda, objavljuje i prve vremenske prognoze. U to se vrijeme na Geofizičkom zavodu prikupljaju makroseizmički podaci, a početkom 20. stoljeća postavljeni su i prvi seizmografi. Radi potreba mjerenja uvodi se sluľba točnog vremena, koja je u javnosti znana po pucnju gričkog topa koji se oglaąava u podne počam od 1876., a od 1926. i označavanjem punog sata putem radija ("... na treći znak Geofizičkog zavoda bilo je točno..."). Mreľa meteoroloąkih postaja Hrvatske vremenom se znatno proąiruje, te se 1946. izdvaja u samostalnu ustanovu (danaąnji Drľavni hidrometeoroloąki zavod), a Geofizički zavod otada djeluje kao znanstveno-nastavna jedinica Prirodoslovno-matematičkog fakulteta.

Seizmoloąka sluľba, koja djeluje u okviru Geofizičkoga odsjeka, brine o prikupljanju i analizi makroseizmičkih i mikroseizmičkih podataka. Na području Republike Hrvatske odrľava u stalnom pogonu pet seizmografa i petnaest akcelerografa kojima prati vibriranja tla uzrokovana potresima u nas i u svijetu.

Mareografska postaja u Bakru od 1929. biljeľi vodostaj Jadranskog mora, a Opservatorij na Puntijarki od 1959. utvrđuje intenzitet Sunčevog zračenja. Automatska meteoroloąka postaja, koja je na Horvatovcu postavljena 1987. godine, biljeľi vrijednosti standardnih meteoroloąkih elemenata (tlaka, temperature zraka i tla, oborine, smjera i brzine vjetra, vlaľnosti zraka, globalnog i difuznog Sunčevog zračenja), a od 1998. i ultraljubičastog zračenja.

U danaąnje znanstvene aktivnosti Geofizičkoga odsjeka uključena su istraľivanja potresa, fizikalnih svojstava Zemljine kore, gibanja u Jadranskom moru, vremena (u meteoroloąkom smislu), klime, međudjelovanja fizikalnih procesa u moru i atmosferi te fizičko-kemijskih promjena u atmosferi u svezi s promjenama klime i ljudskom aktivnoąću. Ta se proučavanja provode prvenstveno za područje Hrvatske, no neki od rezultata značajni su i u svjetskim razmjerima.

Geofizički zavod 'Andrija Mohorovičić' izdaje časopis Geofizika.